一是生产成本上升。新冠肺炎疫情发生后，尽管国家和地方都出台了一系列维护畜牧业正常产

销秩序的政策，但运输车辆明显减少、部分屠宰场停工、个别地区封路等造成连锁反应，使种羊的销售和育肥羊的出栏受到影响。据辽宁朝阳市朝牧种畜场负责人张贺春介绍，一只待售羊按照每天5元的饲养成本计算，100只待售羊的饲养成本每月将增加1.5万元。实际情况是很多羊场的待售羊数量远超过100只，成品羊滞销压栏使生产成本大幅上升。此外，饲料原料涉及到跨省运输，部分羊场储备告急，但供应商产量下降、运输困难、运费翻倍等，也进一步拉高了生产成本。
二是育种工作受阻。自2016年至今，我国已遴选出28家国家肉羊核心育种场。这些肉羊育种场肩负着提升我国肉羊自主制种能力的重任，持续开展种羊登记、核心群生产性能测定等是育种工作中最基础也是最重要的工作，当前由于各地都加大了新冠肺炎疫情防控力度，人员流动大幅下降，部分春节倒休的外地饲养员，因居住地和务工地普遍封城封路，无法返工，人员招聘也困难，面对即将到来的产羔高峰，让部分羊场面临生产人员短缺的局面。由于肉羊生产成本上升、生产人员短缺、饲养员回场还面临隔离防疫等困难，部分核心场的测定工作被迫中断。
三是二三产业受创。国家肉羊核心育种场中大部分都是全产业链企业，很多羊场都有自己的屠宰场、食品厂及餐饮业。新冠肺炎疫情对二、三产业的影响最大，屠宰场关闭，餐饮业暂停，生产、加工、销售等环节产业链断裂，使企业蒙受很大的损失。由于近几年羊业行情较好，许多企业都不断投资扩大生产规模，其中不乏通过贷款发展的企业。新冠肺炎疫情发生后，羊场的现金流大幅减少，成本却不断上升，部分养殖场规模过大，人员工资、饲料消耗等不堪重负。资金压力不断增大。甘肃武威普康养殖有限公司负责人杨清说，公司旗下的餐饮业全部关门，不到一月的时间已损失300余万元。
四是动物福利下降。肉羊滞销不但提高了生产成本，导致的延时出栏增加了饲养密度，给舍饲养殖造成极大压力，同时，养殖场饲料原料不足降低了动物精准营养的效率，日粮配方调整对肉羊的应激加大，对肉羊健康养殖带来极大的风险，直接影响了肉羊动物福利，导致生产性能下降，增加了疫病风险。
针对肉羊核心育种场和规模化羊场遇到的问题和困难，无论是规模化羊场、中小型养殖户，还是从事羊业研究广大科研和推广人员，一定要坚定信心，加强羊场管理，完善技术措施，科学合理安排生产，认真做好动物疫病和新冠肺炎疫情防控，保证国家肉羊核心育种场生产安全。 一要坚持育种工作。2月11日，国务院办公厅印发了《关于加强农业种质资源保护与利用的意见》，开启了农业种质资源保护与利用的新篇章。国家肉羊核心育种场要抓住机遇，不辱使命，克服困难，在防控新冠肺炎疫情的同时，坚持开展育种工作，始终将种羊登记、生产性能测定和遗传评估等基础工作放在首要位置，保证种羊的群体数量和生产性能，真正做到无论何种行情下，都能为行业提供最优质的种羊，保证全国的肉羊遗传改良工作有序开展。
二要加强饲养管理。各场要制定特殊时期的管理制度，严格执行，层层落实，责任到人。尤其要做好饲养人员自我防护管理、生产性能测定管理、饲喂管理、分群管理和场区消毒管理等，要采取精细化的管理和科学的技术措施，如招聘本地工人、减少饲料浪费、及时淘汰低产母羊、调整羊群结构等提高生产效率，消减生产成本。